MES從上個世紀90年代開始發展，剛開始主要是在自動化程度比較高的行業得到廣泛應用。如汽車行業、半導體電子、煙草行業，同時也在食品飲料、工程機械、大型離散裝配、家電行業得以推廣。
自動化設備商仍是MES系統市場的主流供應商，但也難以形成ERP行業的SAP這樣的寡頭。盡管ERP廠商雖然也嘗試進入MES行業，但是，市場拓展效果不佳，很顯然，對資源管理輕車熟路的ERP廠商，對現場控制系統、數據采集，有著與生俱來的生疏和規避。
MES系統的緩慢發展，恰好跟工業化進程密切相關
MES系統的行業性需求與通用型產品之間的矛盾日漸突出，產品化程度不夠。與ERP不同，MES系統從產生開始，就是為了解決通用型的ERP功能難以解決的工廠管控問題，因此，即使有多年的發展，MES系統也無法擺脫行業性對其形成的局限。
與此同時，集成難度是另外一個MES系統難以快速鋪展的門檻。隨著智能工廠的建設熱潮，對于MES的集成提出更高的要求，縱向集成要求MES系統不僅與ERP集成，還要求與控制系統進行集成；不僅要求進行數據采集，還希望實現控制參數、工藝標準的下達。這也對MES供應商提出很大的挑戰。
值得注意的一個現象是，盡管MES系統發展多年，但其產業化規模仍然不足。一個成熟的產業應該是由供應商、服務商(經銷商)和用戶組成的，比如ERP、PLM。而現在的MES系統多是供應商直接面向用戶，產業規模還遠遠沒有發展起來。
實際上，MES系統是一個企業信息化程度的體溫計。由于MES系統的數據表單，來源于工廠的多個角度。因此如果企業自身的工藝資源、制造資源、流程節點不能規范有效的時候，MES系統廠家將不得不撅著屁股，先幫著企業整理自身的資源數字化。想為客戶紡出五彩錦緞，而用戶首先搬出的是一堆攪在一起的亂線頭。這對MES系統廠商往往苦不堪言。
